教皇格列高利不但拒绝会见海军将领恩里克，甚至还拒收了腓特烈的信。教皇认为，腓特烈必须亲自前来拜见教皇，说明事情原委，但他却一边泡着温泉，一边只差人送来一封信，这成何体统！

教皇怒向胆边生，以没有在约定的日期远征为由，决定对皇帝处以“开除教籍”的处罚。

对基督教徒来说，没有比开除教籍更严厉的处罚了。当然，教皇决定这样处置皇帝的理由不仅是这一点。我把这些理由归纳如下。

自幼成为孤儿的腓特烈，之所以能够成为西西里国王，接着成为德意志王，最终还当上了皇帝，这都是托了谁的福？这一切都是因为罗马教皇不惜代价援助的结果。

这份教皇诏书的全文于同一年的11月18日在罗马圣彼得大教堂的正门上张贴出来，正式公布开除腓特烈教籍。教皇格列高利还大量抄写诏书，不仅发送给了欧洲全境的大主教、主教、修道院长，还发送给了全体国王和实力人物。

9月8日，腓特烈因为瘟疫流行而不得不撤回。9月19日，教皇决定开除皇帝的教籍。11月18日，教皇公布了开除教籍的诏书。可以想象，57岁的教皇认为自己被捉弄了，对32岁皇帝的怒火急速飙升。

这个时候，腓特烈也把与他地位相符的辞令抛到了一边。他给教皇写了一封信，直抒胸臆。

“你说是罗马教皇帮助了幼小的我，但在我度过孩提时代的时候，教皇对西西里毫不关心，诸侯为所欲为，整个西西里王国成了无政府状态。在我成长的时代，甚至在我成人之后，把神圣罗马帝国皇帝的帝位授予萨克森公爵奥托的，不也正是罗马教皇吗？

“而我达到今天的地位，究竟是托了教皇的洪福，还是因了在困难时期不遗余力帮助我的意大利和德意志的诸侯呢？”

这又在格列高利教皇的怒火上浇了一桶油。他似乎根本没有看到腓特烈在信的末尾还写着：“我将于明年即1228年春率领十字军出征。”